ПОЛИМОРФИЗМ ФРАГМЕНТОВ МОЛЕКУЛЯРНОГО МУЛЬТИЛОКУСНОГО АНАЛИЗА У КОРОВ ЧЕРНО-ПЕСТРОЙ ПОРОДЫ С РАЗЛИЧНОЙ НАПРАВЛЕННОСТЬЮ ПАПИЛЛЯРНЫХ БОРОЗД НОСОГУБНОГО ЗЕРКАЛА

Ю.В. Аржанкова

ФГОУ ВПО «Великолукская государственная сельскохозяйственная академия», г. Великие Луки, Россия

В генетико-селекционных исследованиях сельскохозяйственных животных большое значение имеет анализ популяций, изучение их гетерогенности, дифференциация и идентификация пород. Использование молекулярных маркеров значительно расширяет возможности генетического анализа популяций, позволяет установить меж- и внутрипородную вариабельность отдельных участков генома и составить представление о генетической структуре породы (В.В. Сулимова, 1999). Однако фенетические исследования также не потеряли своей актуальности. Среди многочисленных фенов крупного рогатого скота представляют интерес дерматоглифы носогубного зеркала (Ю.М. Малофеев,    С.П. Ермакова, П.Б. Шестун, 2005; А

БарановВ, Мсв.Сязиир ост иэнтиам, Лц.е Мльуюра ндаошваи, х 2 и0с0с8л)е. дований было изучение частот встречаемости фрагментов молекулярного мультилокусного анализа в черно-пестрой породе скота в СПК-колхозе «Красное знамя» Новосокольнического района Псковской облаасти. Выделение ядерной ДНК из крови проводилось в лаборатории ДНК-технологий ВНИИплем. Классификация рисунка носогубного зеркала проводилась на основе фотоотпечатка (Ю.В. Аржанкова, 2008).

Анализ частот встречаемости фрагментов ISSR-анализа у черно-пестрых коров, сгруппированных по направленности папиллярных борозд носогубного зеркала, представлен в таблице 1. Все выявленные фрагменты являются полиморфными, т.е. представлены с разной частотой, меньшей единицы.

Фрагмент 1 отсутствует в геноме коров с наклоном борозд «в равной степени». В двух других группах он встречается с практически равной частотой – 0,0385-0,0333.
Фрагмент 2 не выявлен в геноме животных с наклоном «в большей степени вверх» и имеется с частотой 0,0250-0,0333 в других группах скота.
Фрагмент 3 присутствует только у коров с направлением «в большей степени вверх» с частотой 0,0385. В остальных группах он не выявлен.

Значение частоты встречаемости фрагмента 4 колеблется от 0,0385 («в большей степени вверх») до 0,1333 («к периферии»). Различия между крайними вариантами составляют 3,46 раза.
Фрагмент 5 выявлен со сходной частотой у коров с наклоном «в большей степени вверх» и «к периферии», 0,0769 и 0,0667 соответственно, в то время как в группе животных с направлением «в равной степени» она составила 0,1250, что в 1,63-1,87 раза больше.

По фрагменту 6 существенных различий между группами не выявлено. Частота встречаемости варьирует от 0,0667 («к периферии») до 0,0769 («в большей степени вверх»).
Колебания по частоте встречаемости фрагмента 7 характеризуются несколько большими пределами, не превышающими однако 0,0564. Она варьирует от 0,0769 («в большей степени вверх») до 0,1333 («к периферии»).

Таблица 1 - Частоты встречаемости фрагментов для (AG)9С-ISSR у черно-пестрых коров с разной направленностью папиллярных борозд

Фраг­мент

Интервал размера фраг­ментов, п.н.

Направленность папиллярных борозд

в большей степени вверх n=26

в равной

степени

n=40

к

периферии

n=30

1

949-1030

0,0385±0,0377

0,0000±0,0000

0,0333±0,0328

2

873-915

0,0000±0,0000

0,0250±0,0247

0,0333±0,0328

3

809-811

0,0385±0,0377

0,0000±0,0000

0,0000±0,0000

4

558-628

0,0385±0,0377

0,1000±0,0474

0,1333±0,0621

5

516-544

0,0769±0,0523

0,1250±0,0523

0,0667±0,0455

6

483-499

0,0769±0,0523

0,0750±0,0416

0,0667±0,0455

7

467-477

0,0769±0,0523

0,1000±0,0474

0,1333±0,0621

8

453-464

0,2692±0,0870

0,0500±0,0345

0,1667±0,0680

9

412-450

0,1154±0,0627

0,3250±0,0741

0,2667±0,0807

10

395-407

0,0769±0,0523

0,0750±0,0416

0,1333±0,0621

11

368-392

0,1923±0,0773

0,1500±0,0565

0,0333±0,0328

12

331-365

0,4231±0,0969

0,3750±0,0765

0,3667±0,0880

13

309-327

0,1154±0,0627

0,1750±0,0601

0,1667±0,0680

14

288-302

0,0385±0,0377

0,2000±0,0632

0,1333±0,0621

15

269-286

0,4231±0,0969

0,4500±0,0787

0,3333±0,0861

16

248-267

0,5000±0,0981

0,3500±0,0754

0,4333±0,0905

17

226-245

0,2308±0,0826

0,1750±0,0601

0,2667±0,0807

18

209-223

0,1154±0,0627

0,2000±0,0632

0,1667±0,0680

19

180-198

0,0000±0,0000

0,0500±0,0345

0,0333±0,0328

Выявлены значительные различия по частоте встречаемости фрагмента 8. Достаточно низкое значение показателя отмечено в группе коров с наклоном «в равной степени» (0,0500), самое высокое – «в большей степени вверх» (0,2692, что в 5,38 раза больше). Коровы с «периферийным» наклоном характеризуются промежуточным значением, составившим 0,1667.

Значительны полученные различия в частоте встречаемости фрагмента 9. Самое высокое значение выявлено у животных с наклоном «в равной степени» (0,3250), наименьшее – «в большей степени вверх» (0,1154, что в 2,82 раза меньше). Приблизительно у 27% коров с «периферийным» наклоном борозд также имеется этот фрагменФтр. агмент 10 выявлен со сходной частотой в группах коров с наклоном «в большей степени вверх» и «в равной степени», 0,0769 и 0,0750 соответственно. На 0,0564-0,0583 больше оказалась частота встречаемости фрагмента в группе животных с «периферийным» наклоном.

Заслуживает некоторого внимания скот с «периферийным» наклоном папиллярных борозд и в отношении фрагмента 11, который выявлен в этой группе с очень низкой частотой по сравнению с другими – 0,0333 по отношению к 0,1923 («в большей степени вверх») и 0,1500 («в равной степени»).

Фрагмент 12 встречается во всех группах скота с достаточно высокой частотой, варьирующей от 0,3667 («к периферии») до 0,4231 («в большей степени вверх»).
Фрагмент 13 имеет сходную частоту встречаемости в группах скота с наклоном борозд «к периферии» (0,1667) и «в равной степени» (0,1750), в то время как у коров с наклоном «в большей степени вверх» он выявлен с частотой 0,1154, что на 0,0513-0,0596 меньше.

Интересная картина получена в отношении фрагмента 14. Наибольшая частота встречаемости (0,2000) характерна для коров с направлением «в равной степени», несколько меньшее значение выявлено у животных с «периферийным» наклоном (0,1333). В то же время у животных с наклоном «в большей степени вверх» фрагмент встречается с частотой только 0,0385, что в 5,19 и 3,46 раза меньше соответственно.
Сходная частота встречаемости фрагмента 15, составляющая 0,4231 и 0,4500, выявлена у животных с наклоном «в большей степени вверх» и «в равной степени». Однако коровы с «периферийным» наклоном борозд носогубного зеркала имеют в геноме этот фрагмент несколько реже (0,3333), что на 0,0898 и 0,1167 меньше значений других групп.

Фрагмент 16 является очень распространенным во всех группах скота. Наибольшая частота встречаемости характерна для группы коров с наклоном «в большей степени вверх» (0,5000), наименьшая – «в равной степени» (0,3500).

Фрагмент 17 выявлен с частотой, варьирующей от 0,1750 («в равной степени») до 0,2667 («к периферии»).

Частота встречаемости фрагмента 18 колеблется от 0,1154 («в большей степени вверх») до 0,2000 («в равной степени»).

Фрагмент 19 отсутствует в геноме коров с наклоном папиллярных борозд «в большей степени вверх», в двух других группах выявлен с невысокой частотой, составляющей 0,0333-0,0500.

Таким образом, животные с направлением папиллярных борозд «в большей степени вверх» характеризуются отсутствием в геноме фрагментов 2 и 19, которые выявлены в двух других группах скота, при этом только у них обнаружен фрагмент 3. Наибольшая частота встречаемости наблюдается у фрагмента 16 (0,5000). На 0,0769 она меньше у фрагментов 12 и 15. Достаточно низка частота встречаемости фрагментов 1, 3, 4, 14 (по 0,0385) и 5-7, 10 (по 0,0769). По сравнению с двумя другими группами животных данная группа характеризуется более высокой частотой встречаемости фрагмента 8 и более низкой – фрагментов 9, 13 и 14.

В геноме коров, имеющих направление папиллярных бород носогубного зеркала «в равной степени», не выявлено фрагментов 1 и 3. Наиболее часто в группе встречается фрагмент 15 (0,4500). Значение показателя, не превышающее 0,1000, характерно для фрагментов 2 (0,0250); 6 и 10 (по 0,0750); 8 и 19 (по 0,0500). Фрагменты 5 и 14 встречаются у них чаще, а фрагмент 8 – реже, чем у животных с наклоном борозд «в большей степени вверх» и «к периферии».

У коров с «периферийным» наклономпапиллярных борозд отсутствует только фрагмент 3. Наибольшая частота встречаемости выявлена у фрагмента 16 (0,4333). Относительно низкая частота характерна для фрагментов 1, 2, 11 и 19 (по 0,0333); 5, 6 (по 0,0667). Коровы имеют более низкую частоту встречаемости фрагментов 11 и 15, относительно высокую – фрагмента 10 по сравнению с животными с иными характеристиками зеркала.

По среднему числу фрагментов на особь значительных различий между данными группами не выявлено. На одно животное с наклоном папиллярных борозд «в большей степени вверх» приходится 2,85 фрагмента, «в равной степени» – 3,00 фрагмента, «к периферии» – 2,97 фрагмента.

рисунок 1.

Таким образом, ISSR-анализ выявил различия между группами черно-пестрых коров разной направленности папиллярных борозд носогубного зеркала. Большинство фрагментов встречается в группах с различной частотой (рис. 1). Большей частью это касается фрагментов 8, 9, 11 и 14, но в той или иной степени характерно для всех фрагментов.

Литература


1.    Аржанкова Ю.В. Идентификация крупного рогатого скота на основе рисунка носогубного зеркала /Ю.В. Аржанкова //Молочное и мясное скотоводство. – 2008. – №5. – С.31-32.
2.    Сулимова В.В. Методическое пособие: Анализ полиморфизма ДНК с использованием метода полимеразной цепной реакции /В.В. Сулимова. – М., 1999. – 43 с.
3.    Малофеев Ю.М. Дерматология и микроморфология носогубного зеркала маралов /Ю.М. Малофеев, С.П. Ермакова, П.Б. Шестун //Актуальные проблемы патологии животных: материалы Межд. съезда терапевтов, диагностов. – Барнаул: изд-во АГАУ, 2005. – С.105-107.
4.    Баранов А. Строение носогубного зеркала коров разных генеалогических групп /А. Баранов, М. Сиротина, Л. Мурадова //Молочное и мясное скотоводство. – 2008. – №5. – С.30-31.

Источник - ВЕСТНИК МИЧУРИНСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО АГРАРНОГО УНИВЕРСИТЕТА, научно-производственный журнал, 2010, № 2,  Печатная версия.

© 2024 Образовательный портал Тамбовской области